Левдиков: Левдиков Владимир Иванович биография и пресс-портрет

Содержание

Левдиков Николай Николаевич, ГКОУ КШИ № 5, Москва

Занимаемая должность (должности): старший вожатый

Фактическое место работы: ГКОУ КШИ № 5 ул. Лосиноостровская, дом 22А

Уровень образования: высшее

Наименование оконченного учебного заведения: Таллинское высшее военно-политическое строительное училище

Наименование направления подготовки и (или) специальности: по специальности военно-политическая, квалификация: учитель истории и обществознания

Общий стаж работы: 33

Стаж работы по специальности: 5

Данные о повышении квалификации и (или) профессиональной переподготовке (при наличии):

1. ГАОУ ДПО МЦРКПО повышение квалификации » Нормативные, технологические и содержательные подходы к организации дополнительного образования детей в городе Москве» (42 часа) 2018 год

2. ГБОУ ДПО «ЦПВШС» повышение квалификации по дополнительной профессиональной программе «Профессиональное развитие компетентности воспитаттеля кадетского класса общеобразовательной организации» (72 часа) 2018 год

3. ГАОУ ДПО МЦРКПО повышение квалификации «Классный руководитель – руководитель класса. Проектный подход в управлении классом» 2019 год

Опыт работы:

1. Старший вожатый в ОО — 4 года

Андрей Левдиков — Блог на vc.ru

Андрей Левдиков — Блог на vc.ru [ { «id»: 1, «label»: «100%×150_Branding_desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox_method»: «createAdaptive», «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «ezfl» } } }, { «id»: 2, «label»: «1200х400», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «phone» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «ezfn» } } }, { «id»: 3, «label»: «240х200 _ТГБ_desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «fizc» } } }, { «id»: 4, «label»: «Article Branding», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «cfovx», «p2»: «glug» } } }, { «id»: 5, «label»: «300x500_desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «ezfk» } } }, { «id»: 6, «label»: «1180х250_Interpool_баннер над комментариями_Desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «h», «ps»: «bugf», «p2»: «ffyh» } } }, { «id»: 7, «label»: «Article Footer 100%_desktop_mobile», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «tablet», «phone» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «bwkpg», «p2»: «fjxb» } } }, { «id»: 8, «label»: «Fullscreen Desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop», «tablet» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «fjoh» } } }, { «id»: 9, «label»: «Fullscreen Mobile», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «phone» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «fjog» } } }, { «id»: 10, «disable»: true, «label»: «Native Partner Desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop», «tablet» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «clmf», «p2»: «fmyb» } } }, { «id»: 11, «disable»: true, «label»: «Native Partner Mobile», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «phone» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «clmf», «p2»: «fmyc» } } }, { «id»: 12, «label»: «Кнопка в шапке», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «bscsh», «p2»: «fdhx» } } }, { «id»: 13, «label»: «DM InPage Video PartnerCode», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop», «tablet», «phone» ], «adfox_method»: «createAdaptive», «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «h», «ps»: «bugf», «p2»: «flvn» } } }, { «id»: 14, «label»: «Yandex context video banner», «provider»: «yandex», «yandex»: { «block_id»: «VI-223676-0», «render_to»: «inpage_VI-223676-0-1104503429», «adfox_url»: «//ads.
adfox.ru/228129/getCode?pp=h&ps=bugf&p2=fpjw&puid1=&puid2=&puid3=&puid4=&puid8=&puid9=&puid10=&puid21=&puid22=&puid31=&puid32=&puid33=&fmt=1&dl={REFERER}&pr=» } }, { «id»: 15, «label»: «Баннер в ленте на главной», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop», «tablet», «phone» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «byudx», «p2»: «ftjf» } } }, { «id»: 16, «label»: «Кнопка в шапке мобайл», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «tablet», «phone» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «byzqf», «p2»: «ftwx» } } }, { «id»: 17, «label»: «Stratum Desktop», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «fzvb» } } }, { «id»: 18, «label»: «Stratum Mobile», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «tablet», «phone» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «fzvc» } } }, { «id»: 19, «label»: «Тизер на главной 2», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop», «tablet», «phone» ], «auto_reload»: true, «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «cbltd», «p2»: «gazs» } } }, { «id»: 20, «label»: «Кнопка в сайдбаре», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «cgxmr», «p2»: «gnwc» } } }, { «id»: 21, «label»: «Ультратизер», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «pp»: «g», «ps»: «bugf», «p2»: «gtjk» } } }, { «id»: 22, «label»: «300×500 правый сайдбар 1×1», «provider»: «adfox», «adaptive»: [ «desktop» ], «adfox»: { «ownerId»: 228129, «params»: { «p1»: «cotcx», «p2»: «heif» } } } ] {«token»:»eyJhbGciOiJIUzI1NiIsInR5cCI6IkpXVCJ9.
eyJwcm9qZWN0SWQiOiI1ZTRmZjUxODYyOGE2YzcxNDUxNWY0ZGEiLCJpYXQiOjE1ODI1MzY0NDB9.AwBBnUWMy3RR1xtAoaXVr81WvqxdlD4C8CBpwFiONzw»,»release»:»dab8430c»} null

ЛЕВДИКОВ Виктор Васильевич

В

от эти данные были взяты из Всесоюзной книги памяти: 


ЛЕВДИКОВ Виктор Васильевич, подполковник, советник ком-ра афг. батальона «Коммандос», род. 14.6.1947 в пос. Сельцо Брянского р-на Брянской обл. Русский.
В Вооруж. Силах СССР с 25.8.65.
Окончил Рязанское ВВДКУ и Военную Академию им. М.В.Фрунзе.
В Респ. Афганистан с сент. 1983.
9.11.83 во время выдвижения афг. батальона в р-н проведения боевой опер-и БТР, на котором он следовал, подорвался на мине.
При попытке покинуть горящий БТР Л. был тяжело ранен снайпером пр-ка.
11.11.1983 скончался.
Похоронен в г. Кировоград.

В

от эти данные были взяты  с адреса http://probnichekal01.blogspot.ru/2012/03/blog-post. html

ЛЕВДИКОВ Віктор Васильович
народився 14 червня 1947 р, у робітничій сім’ї.
Місце проживання вдови: м. Кіровоград.
До призову на військову службу навчався в школі.
У вересні 1983 р. відправлений підполковником в Афганістан.
Загинув 11 листопада 1983 р.

ЛЕВДИКОВ | Путешествие по Брянску

ЛЕВДИКОВ, х., Погар. р-на, Гетуновского с.п., в 3 км к 3. от ж/д ст. Погар (52°30’35» с.ш., 33°10’20» в.д.). 0,01 тж.; макс. 0,12 т.ж. (1979), до Вел. Отеч. войны преобладало укр. население. Упом. с 1 пол. XIX в.; до 1929 в Стародуб. уезде (в 1861-1888 — в составе Куровской вол., с 1888 в По-гарской вол.). С 1920-х гг. — совхоз «Победа». До 1960 в Борщовском, Лобковском с/с; в 1960-1980 в Роговичском. Инд. 243543.

Левдиков — хутор Погарского района Брянской области, Гетуновского сельского поселения, в 3 км к западу от железнодорожной станции Погар. Упоминается с первой половины XIX века; до 1929 в Стародубском уезде.

 

ЛЕВЕНКА (Левенки), с, Стародуб. р-на, Десяту-ховского с.п., в 8 км к В. от Стародуба, в 3 км к В. от пос. Десятуха (52°35′ с.ш., 32°52’35» в.д.). 0,61 т.ж.; макс. 1,0 т.ж. (1897), до Вел. Отеч. вой­ны преобладало укр. население. По преданию, назв. по фам. стародубского воеводы А. Леви­на, которому эти земли были даны в вотчину за оборону Стародуба в 1535. В XVIII в. — владение Корецких, позднее Кулябок. Приход храма По­крова Богородицы изв. с 1691 до нач. XX в.; по­следнее здание храма было построено Кулябко-Корецкими в 1799 (деревян., не сохр.). С кон. XIX в. работала земская школа. Со 2 пол. XVII в. по в полковой (2-й) сотне Стародуб. полка; с по 1929 в Стародуб. уезде (в т.ч. с 1861 — в составе Стародубской вол.). В сер. XX в. — колхоз «Социализм». С 1919 по 1973 — ц. Левенского с/с; в 1973-2005 в Краснооктябрьском с/с. Отд. связи (инд. 243250), Дом культуры, библиотека, основ­ная школа. Многочисл. археол. пам. V-XII вв. (в т.ч. стан др.-рус. дружины) с остатками древнего металлургич. произв-ва; по одной из версий -место нахождения города Стародуба до XII в.

Левенка (Левенки) — село Стародубского района Брянской области, Десятуховского сельского поселения, в 8 км к востоку от Стародуба, в 3 км к востоку от поселка Десятуха. До Великой Отечественной войны преобладало украинское население.

ЛЕВЕНКА. Село при впадении речки Бабенца в реку Ваблю, по-видимому,

поселена в первой половине ХУ1 века Андреем Левиным, который был на службе

в Стародубском полку. В ХУ1 веке он отличился при обороне г. Стародуба.

Левенки (Лавинка), д. Брянская обл. Близ деревни, на берегу реки Бабинец, недалеко от ее впадения в р. Ваблю (левый берег), округлое городище. Рядом, в устье р. Бабинец открытое селище. Подъемный материал: обломки лепной (роменской IX-X вв.) и гончарной древнерусской (XI-XIII вв.) посуды. Во время разведки 1971 г. установлено, что городище почти полностью уничтожено распашкой и посадкой деревьев.

Село Левенка при впадении р. Бабенца в р. Ваблю, быть может, поселено в перв. полов. XVI в., Андреем Левиным, как догадывается арХ. Филарет. При поляках принадлежало шляхтичу Кохановскому, сын которого (Станислав – тесть Карпа Мокриевича?) после изгнания поляков, остался в Малороссии и жил в Черниговском полку, откуда и владел Левенкой, пока она не была у него отобрана Рославцем. Затем Левенкой владели: Осип Кожуховский, Модзолевский и Михаил Миклашевский, отдавший ее в приданое за дочерью Настасьей, при выдаче за Гамалею. Когда вдова Гамалеи вышла замуж за Корецкого, Скоропадский утвердил за последним и Левенку, как приданое его жены. Затем Левенку унаследовал сын Корецкого Федор и отдал ее в приданое за дочерью Настасьей, женой Григория Иван. Кулябки; с этого времени Левенка стала принадлежать Кулябкам-Корецким. Кз. А. 28 двор Б. 40 двор, 45 Х. Кр.А. б. товарищ Петра Корецкого, грунт. 15 двор и боб. 11 Х.; Степ. Ширая, боб. 3 Х. и Степ. Гудовича боб. 1 Х. Б. Григор. Кулябки, 22 двор, 24 Х.Местность Левенки весьма красива; поселение раскинуто на значительной возвышенности, на восточной стороне, обсеченной глубокими обвалами, – где видны то слои золотистого песка, то камни; внизу течет Вабля, а по скалам и на площади там и здесь кустарники.

Левенка носит на себе название стародубского воеводы Левина, храбро отразившего ляхов от Стародуба в 1534 г. Подвиг храброго воеводы награжден был тем, что ему дана была в отчину земля невдали от Стародуба, и Левин населил ее.

При построении нового храма найдена металлическая дощечка, на которой написано: «основася сия церковь в честь покрова пресв. Богородицы, при святительстве преосвященного Лазаря Барановича, архиепископа черниговскаго, за старанием мене грешнаго инедостойнаго Василя Романовича, козака обывателя стародубская м. дек. 9 д. року 1691». Этот основатель храма был и священником его.

Число прихожан: в 1770 г. 240 м. (160 козаков), 257 ж.; в 1790 г. 316 м. 270 ж., в 1810 г. 337 м. 296 ж.; в 1830 г. 370 м. 337 ж.; в 1850 г. 408 м. 394 ж.; в 1860 г. 434 м. 456 ж.

Открытая информация из ЕГРН о каждой квартире России

Мы помогаем получить выписки ЕГРН для недвижимости по всей России

[94 регион] Байконур

[79 регион] Еврейская автономная область

[83 регион] Ненецкий автономный округ

[20 регион] Чечня

[87 регион] Чукотский автономный округ

Павел Левдиков | Что? Где? Когда?.


Вопросы

Первая лига Москвы сезона 2012/13 гг. 1.1. «Дважды на одни грабли».

Вопрос 1: [Нулевой вопрос]
    [Ведущему: фамилию в вопросе произносить с буквой «Е» на конце.]
    Монтескье. Какую букву мы заменили?

Ответ: Ё.

Источник(и): http://ru.wikipedia.org/wiki/Французско-русская_практическая_транскрипция

Автор: Павел Левдиков

 ! 
Первая лига Москвы сезона 2012/13 гг. 1.1. «Дважды на одни грабли».

Вопрос 2: У известного ЕГО была ОНА с грибами. А вот в «магазине» из игры «Plants vs Zombies», где игрок сражается с зомби при помощи различных растений, автор вопроса заметил ящик с надписью, созвучной с английским переводом названия романа XIX века, в которой упоминаются ОНА и ОН. Назовите ЕГО и ЕЕ.

Ответ: Горох, война.

Царь Горох в русской сказке и советском мультфильме воевал с грибами. В магазине в качестве боеприпасов продается ящик с горохом, на котором написано «Warandpeas».

Источник(и):
    1. http://ru.wikipedia.org/wiki/Как_грибы_с_горохом_воевали
    2. Игра «Plants vs Zombies».
    3. http://plantsvszombies.wikia.com/wiki/Crazy_Dave’s_Twiddydinkies?file=CD_Page_1.JPG

Авторы: Екатерина Свищёва, Павел Левдиков

 ! 
Первая лига Москвы сезона 2012/13 гг. 1.1. «Дважды на одни грабли».

Вопрос 3: В 1257 году посольство империи Канем привезло высочайшей особе одной из соседних стран немало дорогих и изысканных подарков. Историк Теа Бюттнер в своей книге утверждает, что был в числе прочих и ОН, точнее, ОНА. На территории какого современного государства находилась бОльшая часть территории империи Канем?

Ответ: Чад.

«Высочайшей» и «изысканных» — намек на жирафа (Теа Бюттнер упоминает жирафу). Вполне возможно, Гумилев тоже был в курсе этой истории.

Источник(и):
    1. http://rikonti-khalsivar.narod.ru/buttner4.htm
    2. http://ru.wikipedia.org/wiki/Канем-Борно
    3. Н. Гумилев «Жираф».

Автор: Павел Левдиков

 ! 
Первая лига Москвы сезона 2012/13 гг. 1.1. «Дважды на одни грабли».

Вопрос 5: В статье журнала «Популярная механика» рассказывается о проекте добычи электроэнергии в пустыне Сахара. Огромные площади пустыни будут покрыты конструкциями параболической формы, которые будут фокусировать отраженный солнечный свет на небольшие трубки с теплоносителем внутри. Вряд ли для удовлетворения потребностей человечества будет достаточно 10 тысяч таких конструкций — здесь явно понадобятся более точные расчеты. Но все-таки статья была озаглавлена так же, как и известная советская повесть. Воспроизведите ее название.

Ответ: «Королевство кривых зеркал».

А в той самой повести задача о количестве зеркал была решена простым умножением.

Источник(и): «Популярная механика», 2012, N 5.

Автор: Павел Левдиков

 ! 
Первая лига Москвы сезона 2012/13 гг. 1.1. «Дважды на одни грабли».

Вопрос 10: Некоторое время назад стартовал необычный конкурс для российских школьников — если воспринимать задание буквально, детям предложили нарисовать каракули. Впрочем, рожденные детской фантазией композиции (необязательно, кстати, состоящие из шести элементов) получились весьма оригинальными и красочными. Предполагается, что рисунок победителя конкурса в течение завтрашнего дня сможет увидеть вся страна, а сам победитель посетит штаб-квартиру. Чью?

Ответ: Google.

Каракули — один из переводов слова «doodle». Детям предложили нарисовать googledoodle, работа победителя в течение суток будет украшать главную страницу сайта google.ru.

Источник(и): http://www.google.ru/doodle4google/info.html

Автор: Павел Левдиков

 ! 
Турнир «Five o’clock» (Москва). 3 тур.

Вопрос 3: Недавно археологи из США провели масштабные раскопки к юбилею громкого события. Реконструкции помогли большое количество найденных ключей и осколков стекла. Назовите место, где происходили раскопки.

Ответ: Вудсток.

Археологи из Бингемтонского университета (США) исследовали место проведения знаменитого рок-фестиваля «Вудсток». Специалисты рассчитывали выяснить, где именно находилась сцена, на которой выступали легендарные Джими Хендрикс, Дженис Джоплин, Джо Кокер и многие другие. Ключи, о которых идет речь в вопросе, — ключи от пивных банок.

Источник(и):
    1. http://www.vokrugsveta.ru/news/296007/
    2. https://phys.org/news/2018-06-archaeologists-scour-woodstock-concert-field.html

Автор: Павел Левдиков (Москва)

 ! 
Традиционный 5 o’clock 2019.

Вопрос 8: Сборник «Эссе и Обзоры» под редакцией Джона Уильяма Па́ркера описывает процесс появления библейских текстов и их дальнейшую судьбу. Интересно, что «Эссе и обзоры» вышли на четыре месяца позже НЕГО и первое время были значительно популярнее. Назовите ЕГО.

Ответ: «Происхождение видов».

Зачёт: «Происхождение видов путём естественного отбора», «Происхождение видов путём естественного отбора, или Сохранение благоприятных рас в борьбе за жизнь».

Ныне забытая работа Паркера была более популярной и обсуждаемой, чем вышедшая в то же время работа Дарвина, но проиграла эту борьбу за выживание в истории и сейчас известна в основном лишь в академических кругах.

Источник(и): https://en.m.wikipedia.org/wiki/Essays_and_Reviews

Автор: Павел Левдиков

 ! 

Широко распространенное семейство серин / треониновых протеинфосфатаз имеет общий регуляторный переключатель с протеасомными протеазами

Резюме:

В этой статье Bradshaw, Losick и соавторов представлены доказательства того, что PP2C-подобная фосфатаза SpoIIE в B. subtilis претерпевает конформационные изменения при активации, которые включают димеризацию и вращение двух ключевых спиралей, которые способствуют связыванию двухвалентных ионов, важных для катализа. Структуры убедительны и очень напоминают предложенную модель, а биохимические и генетические данные подтверждают эту модель.Примечательно, что авт. Синтезируют свои открытия со структурами некоторых др. Белков семейства PP2C, чтобы предположить, что сходный переключатель используется во всем этом семействе белков, в том числе в протеасомных протеазах. Хотя каждый из рецензентов с энтузиазмом воспринял документ и определение общего механизма переключения регулирующих органов, некоторые аспекты документа можно было улучшить.

В дополнение к изменениям, перечисленным ниже, которые непосредственно связаны с комментариями рецензентов, мы внесли несколько изменений, чтобы усилить рукопись:

  • Мы дополнительно доработали модель для конструкции SpoIIE 457-827 .Статистика для структуры немного улучшилась и была обновлена ​​в Таблице 1. Большинство изменений касались тонких корректировок боковых цепей, но мы смогли создать «откидную» область для нескольких цепочек, и теперь это отражено на Рисунке 5. — приложение к рисунку 4.

  • Мы изменили название, чтобы сделать его доступным для более широкой аудитории (мы отказались от PP2C).

  • Мы изменили обсуждение эволюционных последствий наших открытий, чтобы подчеркнуть несовместимость каталитических механизмов фосфатаз PP2C и протеасомных протеаз.

  • Мы добавили два дополнительных видео (морфы), которые иллюстрируют аллостерические регуляторные механизмы SpoIIE и HslV.

Существенные изменения:

Данные на рисунке 2 — дополнение к рисунку 1 можно было бы лучше представить в виде рисунка и текста. Во-первых, профиль дикого типа показан серой линией, но соответствующее изображение не показано и будет полезно для непосвященного читателя.

Мы добавили изображение репрезентативной клетки дикого типа на рисунок.

Кроме того, возникла путаница в отношении утверждения о том, что «результаты показали, что непрерывная область интерфейса димера, состоящая из шести остатков из длинной α-спирали регуляторного домена и двух остатков из переключающих спиралей, была необходима для всех трех аспектов. функции SpoIIE «. Неясно, какие 8 остатков здесь имеют в виду авторы. На рис. 2В выделено всего 12 позиций, на рис. 2D выделено 10 остатков на границе раздела, а на рис. 2 — дополнение к рисунку 1 показаны данные для 16 мутантов, все из которых кажутся в некоторой степени дефектными по крайней мере в одном из показанных анализов.Некоторая путаница также возникает из-за очевидной ошибки в тексте в подразделе «Аминокислотные замены в функции блока интерфейса димера» — «два» должно быть «три» (т.е. E639, E642 и I667), как указано на рисунке. 2Б легенда. Короче говоря, необходимо значительное улучшение ясности — почти казалось, что авторы пытались быть здесь настолько лаконичными, что сделали этот раздел довольно непрозрачным.

Мы добавили текст, чтобы явно указать остатки, на которые мы ссылаемся: шесть остатков из длинной α-спирали регуляторного домена — это V480, L484, V487, M491, F494 и I498, а также три остатка из переключающих спиралей L646. , I650 и T663 (подраздел «Аминокислотные замены в функции блокировки интерфейса димера»).

Кроме того, что, возможно, наиболее важно, неясно, можно ли утверждать, что «все три аспекта» функции (см. Аналогичное утверждение в подразделе «Перемещение области переключения необходимо для активации фосфатазы») у этих мутантов нарушаются, если один из эти функции — стабильность, то есть, если она нестабильна, вы не можете оценить активность или локализацию фосфатазы, поскольку в ней нет белка! Необходимо было бы стабилизировать нестабильные мутанты другим способом, например путем мутации протеазы, а затем оценить активность и локализацию фосфатазы.

Хорошее замечание! Ранее мы сделали это только для одного из мутантов (L646K). Мы удалили метку деградации FtsH из девяти вариантов SpoIIE, которые были дестабилизированы, и проанализировали уровни белка SpoIIE и активацию σ F во время споруляции. Мы обнаружили, что все девять вариантов накапливались до уровней, существенно превышающих SpoIIE, содержащий метку деградации FtsH, но, тем не менее, все варианты были дефектными для активации σ F . Мы добавили эти данные к рисунку 2 — добавление к рисунку 1 в виде панели C.

Результаты рисунка 2 — приложение к рисунку 1 кажутся настолько важными для выводов статьи, что они действительно должны быть в основном рисунке.

Поскольку на рис. 2 суммированы результаты, представленные на рис. 2 — приложение к рисунку 1, мы считаем, что лучше всего использовать этот рисунок в качестве дополнения. Онлайн-формат eLife , в котором дополнительные рисунки становятся легко доступными, щелкнув по основному рисунку, особенно подходит для облегчения доступа к базовым данным, обобщенным в основной рисунок.Однако, если рецензенты твердо убеждены в этом, мы были бы готовы включить его в качестве основной фигуры.

Авторы, по-видимому, предполагают, что мутации, влияющие на функцию, должны устранять димеризацию, но нет прямого анализа димеризации для большинства мутантов, кроме одного, показанного на рисунке 4 — приложение к рисунку 1 (L484K).

Мы предположили, что замена нативных аминокислот на границе димера на лизин нарушит границу раздела димера из-за введения объемной аминокислоты с положительным зарядом. Мы добавили текст, в котором говорится: «Мы заменили нативные аминокислоты лизином, потому что введенный заряд и длинная боковая цепь, как ожидается, предотвратят димеризацию», чтобы прояснить наши рассуждения. В соответствии с нашими рассуждениями, положения аминокислотных замен, которые производят фенотипы, сгруппированы в димерном интерфейсе, и вариант, который мы тестировали in vitro (L484K), блокировал димеризацию.

А другой, D628A, не кажется таким дефектным в образовании димеров, что противоречит утверждению в конце первого абзаца подраздела «Mn 2+ стимулирует димеризацию и активность фосфатазы».

Мы изменили текст, чтобы указать, что замена D628A частично блокирует индуцированное марганцем образование димера. Тот факт, что для варианта D628A все еще происходит некоторая димеризация, неудивителен, поскольку другие координационные остатки металла все еще присутствуют (включая G629), и в эксперименте использовались высокие концентрации белка и MnCl 2 (текст был добавлен к легенде к рисунку 4 — приложение к рисунку 1).

Если, как утверждают авторы в первом абзаце подраздела «Доказательства, полученные от мутантов с усилением функции, что репозиции переключающих спиралей достаточно для активации фосфатазы», ​​V697 играет решающую роль в стабилизации неактивного состояния, то это кажется например, заменить его остатками, отличными от просто аланина, например.грамм. заряженные или объемные полярные остатки также должны дестабилизировать неактивное состояние, вызывая гиперактивность. Было ли это проверено или может быть проверено?

Да. Мы выделили дополнительный супрессорный аллель в этом положении (V697F), который гиперактивирует SpoIIE, что соответствует рассуждениям автора обзора. Мы включили это в текст (подраздел «Структура фосфатазного домена»).

Для всех мутантов с усилением функции предсказано, что они являются конститутивными димерами — можно ли это проверить биохимически, например.грамм. используя анализ SEC-MALLS на рисунке 4?

Мы сосредоточились на варианте V697A, поскольку он имеет несколько отличительных характеристик: (1) V697A — единственный вариант, который мы изолировали в кристаллизованном фрагменте, который привел к гиперактивности SpoIIE в контексте дикого типа (усиление функции мутанты были выделены как супрессоры дефектных аллелей SpoIIE) и (2) замена V697A восстанавливает активность фосфатазы для всех протестированных нами аллелей SpoIIE, которые нарушают активацию SpoIIE (за исключением аллелей, нарушающих каталитический центр). Мы не тестировали другие варианты in vitro, но подозреваем, что некоторые из них могут иметь аналогичные, хотя и более мягкие эффекты.

Или любая из мутаций с усилением функции активируется без димеризации?

Основываясь на неопубликованных данных, у нас есть доказательства того, что замена V697A может способствовать активности SpoIIE независимо от димеризации (как можно было бы предсказать из нашей модели активации SpoIIE). В частности, экспрессия фрагмента домена PP2C SpoIIE 590-827 in vivo не поддерживает активацию σ F , но активация σ F может быть частично устранена заменой V697A в конструкции SpoIIE 590-827 .Поскольку у этого фрагмента отсутствует регуляторный домен, который определяет димеризацию, это подтверждает гипотезу о том, что V697A может способствовать активности SpoIIE в отсутствие димеризации.

Структура, которая, как утверждается, представляет активную форму, вероятно, не имеет второго иона марганца в активном центре. Карта аномальных различий на рисунке 3 — приложение к рисунку 3 предполагает, что присутствует только один ион марганца. Авторы заявляют, что «количество связанных атомов металла не может быть установлено», но не обращают внимания на очевидное отсутствие второго иона марганца.Был ли белок проанализирован с помощью атомно-абсорбционной спектроскопии? Кроме того, что касается количества атомов Mn, указанного на карте аномальных различий Mn: поскольку разрешение было настолько низким (5,4 Å ), не исключено, что два атома (или один атом) могут появиться как одна капля электронной плотности. Авторы могли бы расширить свое обсуждение здесь и, возможно, включить плотность в свое выравнивание на Рисунке 3 — добавление к рисунку 3, панель C.

Как уже отмечалось, SpoIIE 457-827 не содержал марганца в условиях, которые мы использовали для кристаллизации и определения структуры SpoIIE 457-827 (мы подтвердили отсутствие марганца в кристаллах с помощью сканирования рентгеновской флуоресценции). Мы согласны с тем, что аномальные карты с низким разрешением не являются окончательными в отношении количества ионов марганца, связанных в структуре (или местоположения связанного марганца), и изменили текст, чтобы прояснить этот момент (подраздел «Спирали переключателя перемещают сохраняющуюся остаток, координирующий марганец, в активный центр », последний абзац). Плотность для цепочки A была показана на рисунке 3 — добавление к рисунку 4, панель A, и мы добавили карты плотности для активных сайтов других четырех цепочек на эту панель рисунка.Мы не анализировали белок с помощью атомно-абсорбционной спектроскопии из-за низкого сродства связывания марганца, однако мы представляем новые биохимические доказательства того, что SpoIIE использует два иона марганца в каталитическом сайте на рисунке 4C. Расширяя ферментативный анализ активности фосфатазы SpoIIE с лучшими данными при низких концентрациях марганца, мы обнаружили, что SpoIIE совместно активируется марганцем с коэффициентом Хилла, равным двум, что указывает на то, что для катализа требуются по крайней мере два иона марганца, что согласуется с предложенным модель каталитической активности SpoIIE. Мы добавили обсуждение этого момента в рукопись (подраздел «Mn 2+ стимулирует димеризацию и активность фосфатазы», ​​второй абзац).

В связи с предыдущим комментарием, пытались ли авторы кристаллизовать или количественно определить марганец для SpoIIE 457-827 с замещением, которое конститутивно активирует?

Мы еще не пытались кристаллизовать фрагмент SpoIIE 457-827 с заменой V697A, но согласны с тем, что это может облегчить получение структуры с высоким разрешением, связанной с марганцем.

На Рисунке 2 — добавление к рисунку 1A, 5 из 7 мутантов в правом столбце, по-видимому, неправильно локализуют SpoIIE ближе к полюсу передспоры, что авторы игнорируют. Могут ли авторы дать объяснение?

Мы добавили текст к легенде рисунка 2 — добавление к рисунку 1, поясняющее этот момент: «После активации σ F SpoIIE рекрутируется обратно на поверхность передспоры асимметричной перегородки, а затем перемещается вместе с поглощающей мембраной, чтобы охватить передспоры, таким образом, мутанты с наиболее серьезными дефектами активации σ F имеют профили флуоресценции, которые слегка смещены в сторону полюса передспоры по сравнению с клетками дикого типа.

В легенде панели D рисунка 1 указано, что в асимметричной единице есть два с половиной димера. Выявляет ли согласование пяти моделей SpoIIE структурные различия?

Есть тонкие различия между цепочками, которые можно обнаружить при разрешении наших данных, но они в основном ограничены областями контактов кристаллов. Некоторые цепи имеют плотность в области «откидной створки», которую мы построили и добавили к рисунку 5 — добавление к рисунку 4.

Авторы, кажется, подразумевают, что замена домена SpoIIE является артефактом кристаллизации.Кратко объясните аргументы за или против биологической значимости димера с заменой домена.

Исследования раствора фрагмента SpoIIE 590-827 показали, что он является мономерным в физиологических условиях и может образовывать димеры с заменой доменов в условиях кристаллизации (более подробно это обсуждается в Levdikov et al. 2012). Кроме того, наша структура мутанта A624I показала, что основные конформационные различия между структурой с заменой домена и димерной структурой не вызваны заменой домена. Наконец, более объемные алифатические боковые цепи обнаруживаются в положении, соответствующем A624 в ортологах SpoIIE. Хотя мы не можем исключить возможность того, что димер с заменой домена является физиологически значимым, мы не одобряем его по этим причинам.

https://doi.org/10.7554/eLife.26111.048

RCSB PDB — 1A48: SAICAR SYNTHASE

Биосинтез ключевых метаболических компонентов представляет большой интерес для биологов. Исследования синтеза пуринов de novo направлены на более глубокое понимание этого центрального пути и разработку эффективных химиотерапевтических средств.Синтаза фосфорибозиламиноимидазолесукцинокарбоксамид (SAICAR) катализирует седьмую из десяти ступеней биосинтеза пуриновых нуклеотидов …

Биосинтез ключевых метаболических компонентов представляет большой интерес для биологов. Исследования синтеза пуринов de novo направлены на более глубокое понимание этого центрального пути и разработку эффективных химиотерапевтических средств. Фосфорибозиламиноимидазолесукцинокарбоксамид (SAICAR) -синтаза катализирует седьмую ступень из десяти в биосинтезе пуриновых нуклеотидов.На сегодняшний день описана только одна структура фермента, участвующего в биосинтезе пурина: аденилосукцинатсинтетаза, которая катализирует первую коммитируемую стадию синтеза AMP из IMP.


Ссылки по теме: & nbsp
  • [Субстратная специфичность фосфорибозил-аминоимидазол-сукцинокарбоксиамид-синтетазы (сайкар-синтетазы) из дрожжей Saccharomyces Cerevisiae] (русский) В.Д., Зубова В.А., Смирнов М.Н.
    (1992) Biokhimiia & nbsp 57: 845
  • Кристаллизация и предварительное рентгеновское исследование фосфорибозиламиноимидазолесукцинокарбоксамид-синтазы из дрожжевых сахаров Saccharomyces Cerevisiae & nbsp; VMBR, Adamin & NBSP; Мясников А Н
    (1992) J Mol Biol 228: 298
  • De Novo Purine Nucleotide Biosynthesis
    Zalkin, H. , & nbspDixon, JE
    (1992) Prog Nucleic Acid Res Mol Biol & nbsp 42: 259
  • Ген Ade1 Saccharomyces Cerevisiae: структура, сверхэкспрессия и возможное регулирование посредством общего контроля аминокислот и NBSPV, Myasna , , Myasna Янулайтис А.А., Смирнов М.Н.
    (1991) Ген & nbsp 109: 143
  • [Выделение и свойства фосфорибозил-аминоимидазол-сукцинокарбоксиамид-синтетазы из дрожжей Saccharomyces Cerevisiae]
    Останин К.В., Аленин В.В., Домкин В.Д., Смирнов М.Н.
    (1989) Biokhimiia 54: 1265
  • [Нуклеотидная последовательность гена Ade 1 дрожжей Saccharomyces Cerevisiae] (русский язык)
    Мясников А.Н. , ГК, Янулайт, А.А.
    (1986) Биоорг Хим 12: 555

Организационная принадлежность :

Институт кристаллографии РАН, Ленинский, Москва[email protected] chem.uga.edu


Скрыть аннотацию полностью

Недавние публикации лаборатории А.Л. Соненшейна

Бисвас Р., Соненшейн А.Л., Белицкий Б.Р. 2020. Роль GlnR в контроле экспрессии генов метаболизма азота в Listeria monocytogenes . J Bacteriol. 202: e00209-20. Аннотация

Бисвас Р, Соненшейн А.Л., Белицкий Б.Р. 2020. Полногеномная идентификация Listeria monocytogenes CodY-связывающих сайтов. Mol Microbiol. 113: 841-858. Аннотация

Bouillaut L, Newton W, Sonenshein AL, Белицкий BR.2019. DdlR, важный транскрипционный регулятор биосинтеза пептидогликана в Clostridioides difficile . Mol Microbiol. 112: 1453-1470. Аннотация

Bouillaut L, Dubois T., Francis MB, Daou N, Monot M, Sorg JA, Sonenshein AL, Dupuy B. 2019. Роль глобального регулятора Rex в контроле над NAD + -регенерация в Clostridioides (Clostridium) difficile . Mol Microbiol. 111: 1671-1688. Аннотация

Дау Н, Ван И, Левдиков В.М., Нандакумар М, Ливни Дж. , Буйло Л., Благова Е., Чжан К., Белицкий Б.Р., Ри К., Уилкинсон А.Дж., Сунь Х, Соненшейн А.Л.2019. Влияние белка CodY на метаболизм, споруляцию и вирулентность у Clostridioides difficile риботипа 027. PLoS One 14: e0206896. Аннотация

Wang Y, Wang S, Bouillaut L, Li C, Duan Z, Zhang K, Ju X, Tzipori S, Sonenshein AL, Sun X. 2018. Пероральная иммунизация нетоксигенными штаммами Clostridium difficile , экспрессирующими химерные фрагменты TcdA и TcdB. защитный иммунитет против инфекции C. difficile как у мышей, так и у хомяков. Заражение иммунной.86: e00489-00518. Аннотация

Rothstein DM, Lazinski D, Osburne MS, Sonenshein AL. 2017. Мутация в гене Bacillus subtilis rsbU , ограничивающая синтез РНК во время споруляции. J Bacteriol. 99. pii: e00212-17. Аннотация

Левдиков В.М., Благова Е.В., Янг В.Л., Белицкий Б.Р., Лебедев А, Соненшейн А.Л., Уилкинсон А.Дж. 2017. Структура аминокислот с разветвленной цепью и глобального регулятора восприятия GTP, CodY, из Bacillus subtilis . J Biol Chem. 292: 2714-2728.Аннотация

Barbieri G, Albertini AM, Ferrari E, Sonenshein AL, Белицкий BR. 2016. Взаимодействие CodY и ScoC в регуляции основных внеклеточных генов протеаз Bacillus subtilis . J Bacteriol. 198: 907-920. Аннотация

Белицкий BR, Brinsmade SR, Sonenshein AL 2015. Промежуточные уровни активности Bacillus subtilis CodY необходимы для дерепрессии пермеазы аминокислот с разветвленной цепью, BraB. PLoS Genet. 11: e1005600. Аннотация

Ричардсон АР, Сомервилль, Джорджия, Соненшейн, АЛ.2015. Регулирование пересечения метаболизма и патогенеза у грамположительных бактерий. Microbiol Spectr. 3. Аннотация

Sand A, Holwerda EK, Ruppertsberger NM, Maloney M, Olson DG, Nataf Y, Borovok I, Sonenshein AL, Bayer EA, Lamed R, Lynd LR, Shoham Y. 2015. Три гена целлюлосомной ксиланазы в C. thermocellum являются регулируется как вегетативным SigA (σ A ), так и альтернативным SigI6 (σ I6 ) факторами. FEBS Letts. 589 (20 баллов B): 3133-3140. Аннотация

Белицкий BR, Barbieri G, Albertini AM, Ferrari E, Strauch MA, Sonenshein AL.2015. Интерактивное регулирование Bacillus subtilis глобальных регуляторов CodY и ScoC. Mol Micrbiol. 97: 698-716. Аннотация

Bouillaut L, McBride S, Sorg JA, Schmidt DJ, Suarez JM, Tzipori S, Mascio C, Chesnel L, Sonenshein AL. 2015. Влияние суротомицина на жизнеспособность Clostridium difficile и продукцию tPLosoxin in vitro. Противомикробные агенты Chemother. 59: 4199-4205. Аннотация

Barbieri G, Voigt B, Albrecht D, Hecker M, Albertini AM, Sonenshein AL, Ferrari E, Belitsky BR.2015. CodY регулирует экспрессию внеклеточных протеаз Bacillus subtilis Vpr и Mpr. J Bacteriol. 197: 1423-1432. Аннотация

Bouillaut L, Dubois T, Sonenshein AL, Dupuy B. 2014. Интеграция метаболизма и вирулентности в Clostridium difficile . Res Microbiol. 166: 375-383. Аннотация

Лобель Л, Сигал Н, Боровок И, Белицкий Б. Р., Соненшейн А.Л., Херсковиц А.А. 2015. Регулятор метаболизма CodY связывает метаболизм Listeria monocytogenes с вирулентностью, напрямую активируя регуляторный ген вирулентности prfA.Mol Microbiol. 95: 624-644. Аннотация

Brinsmade SR, Alexander EL, Livny J, Stettner AI, Segrè D, Rhee KY, Sonenshein AL. 2014. Иерархическая экспрессия генов, контролируемых глобальным регуляторным белком CodY Bacillus subtilis . Proc Natl Acad Sci USA 111: 8227-8232. Аннотация

Roux A, Todd DA, Velázquez JV, Чех Н.Б., Sonenshein AL. 2014. CodY-опосредованная регуляция системы Staphylococcus aureus Agr объединяет сигналы питания и плотности популяции.J Bacteriol. 196: 1184-1196. Аннотация

Shulami S, Shenker O, Langut Y, Lavid N, Gat O, Zaide G, Zehavi A, Sonenshein AL, Shoham Y. 2014. Множественные регуляторные механизмы контролируют экспрессию гена Geobacillus stearothermophilus для внеклеточной ксиланазы. J Biol Chem. 289: 25957-25975. Аннотация

Mooyottu S, Kollanoor-Johny A, Flock G, Bouillaut L, Upadhyay A, Sonenshein AL, Venkitanarayanan K. 2014. Карвакрол и транс-коричный альдегид снижают выработку токсина Clostridium difficile и цитотоксичность in vitro.Int J Mol lSic. 15: 4415-4430. Аннотация

ПРОЗИТ

ПРОФИЛЬНАЯ документация PDOC00792

Описание

Протеин-фосфатазы удаляют фосфатные группы из различных белков, которые ключевые компоненты ряда сигнальных путей у эукариот и прокариоты. Протеиновые фосфатазы, дефосфорилирующие остатки Ser и Thr делятся на фосфопротеин (PPP) и протеинфосфатазу. Mg (2 +) — или Mn (2 +) — зависимые (PPM) семьи.Основная структура PPM — это Фосфатазный домен PPM-типа из 300 остатков, который катализирует дефосфорилирование фосфосерин- и фосфотреонинсодержащего белка. Тип PPM фосфатазный домен обнаруживается как модуль в различных структурных контекстах и ​​является модулируется нацеливающими и регуляторными субъединицами [1,2,3,4].

Некоторые белки, о которых известно, что они содержат домен фосфатазы PPM-типа, перечислены ниже:

  • Bacillus subtilis, стадия II споруляции, белок E (SpoIIE), контролирует споруляция путем дефосфорилирования анти-транскрипционного фактора SpoIIAA, изменение действия протеинкиназы SpoIIAB в процессе, который управляется соотношением АДФ / АТФ [левдиков].
  • Mycobacterium tuberculosis Ser / Thr-фосфатаза семейства PP2C (PstP).
  • Эукариотический PP2C, негативный регулятор каскадов протеинкиназ, которые активируется в результате стресса.
  • Дрожжевая аденилциклаза, играет важную роль в регуляции клеточного метаболизм, катализируя синтез второго мессенджера, цАМФ.
  • Митохондриальная пируватдегидрогеназа фосфатаза 1 (PDP1) млекопитающих.
  • Связанная с киназой растений протеинфосфатаза (KAPP), регулирует рецептор-подобную пути передачи сигналов киназы (RLK).
  • Растение, нечувствительное к кислоте 1 и 2 (ABI1 и ABI2), играет ключевую роль абсисса кислотная (ABA) сигнальная трансдукция.

Домен фосфатазы типа PP2C состоит из 10 сегментов β-тяжей и 5 сегментов α-спирали и состоит из пары обособленных подобластей. Первое представляет собой небольшой β-сэндвич с нитями β1, упакованными относительно нитей β2 и β3; второй — более крупный β-сэндвич, в котором четырехцепочечный β-heet упаковывается против трехцепочечного β-листа с фланкирующими α-спиралями. (см. ) [1,3].

В качестве образца сигнатуры мы выбрали наиболее консервативную область, которая расположена в N-концевой части и содержит совершенно консервативный трипептид. Этот область включает консервативный остаток аспартата, участвующий в двухвалентном катионе привязка [1]. Мы также разработали профиль, охватывающий весь тип PPM. фосфатазный домен.

Последнее обновление:

февраль 2015 г. / Текст отредактирован; профиль добавлен.

————————————————- ——————————

Техническая часть

PROSITE методы (с инструментами и информацией), описанные в этой документации:

ППМ_2, ПС51746; Профиль фосфатазного домена PPM-типа (MATRIX)
ППМ_1, ПС01032; Сигнатура фосфатазного домена PPM-типа (ШАБЛОН)

Список литературы


1 Авторы Das A. К. Помогает Н. Коэн P.T.W. Barford D.
Название Кристаллическая структура протеина серин / треонинфосфатаза 2C при разрешении 2,0 A.
Источник EMBO J. 15: 6798-6809 (1996).
PubMed ID 55

2 Авторы Rodriguez P.L.
Название Функция протеинфосфатазы 2C (PP2C) у высших растений.
Источник Завод Мол. Биол. 38: 919-927 (1998).
PubMed ID 9869399

3 Авторы Левдиков В.М. Благова Е.В. Роулингс А.Э. Джеймсон К. Тунали Дж. Харт Д. Дж. Барак И. Уилкинсон А.Дж.
Название Структура фосфатазного домена детерминанты судьбы клетки SpoIIE из Bacillus subtilis.
Источник J.Мол. Биол. 415: 343-358 (2012).
PubMed ID 22115775
DOI 10.1016 / j.jmb.2011.11.017

Y.
4 Авторы Заголовок Функциональный анализ консервативных аминокислотных остатков в Mn (2 +) -зависимой протеинфосфатазе, Pph4, из Myxococcus xanthus.
Источник J. Biochem.152: 269-274 (2012).
PubMed ID 22668558
DOI 10.1093 / jb / mvs067

Авторское право


Права на PROSITE принадлежат Швейцарскому институту биоинформатики SIB и распространяется под лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives (CC BY-NC-ND 4. 0) Лицензия, см. Prosite_license.html.

Разное


Просмотреть запись в формате оригинального документа PROSITE
Просмотреть запись в формате исходного текста (без ссылок)

Публикации


Zhang H, W, Li X, Rui X, Sun M, Dong.Lactobacillus plantarum 70810 из китайского paocai в качестве потенциального источника β-галактозидазы для синтеза пребиотических галактоолигосахаридов. Eur Food Res Technol. 236: 817-826, 2013.

https://link.springer.com/article/10.1007/s00217-013-1938-5

Стил Дж, К., Чен Х, Сунь Й, Чжан Х, Ван С. , Ципори и Х., Фен. Токсемия является причиной системного заболевания на моделях инфекции Clostridium difficile у поросят и мышей. J. Infect. Дис. 205 (3): 384-91, 2012.

https: // www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(11)62636-X/abstract


Wu J, Lu Z, Nie M, Zhou H, Sun X, Xue X, Bi J, Fang G. Оптимизация процедур криоконсервации для эндотелиальные клетки-предшественники свиней. Журнал биологии и биоинженерии. 113 (1): 117-23, 2012.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22036230

Стил Дж, Чен К., Сунь Х, Чжан И, Ван Х, Ципори С. , Feng H. Системное распространение токсинов A и B Clostridium difficile связано с тяжелым смертельным заболеванием на животных моделях.Журнал инфекционных болезней. 205 (3): 384-91, 2012.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22147798

Wang H, Sun X, Zhang Y, Li S, Chen K, Shi L , Nie W., Kumar R, Tzipori S, Wang J, Savidge T., Feng H. Вакцина с химерным токсином защищает от первичной и рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. Инфекция и иммунитет. 80 (8): 2678-88, 2012.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22615245

Sun X, Wang H, Zhang Y, Chen K, Davis B, Feng H .Модель рецидива инфекции Clostridium difficile на мышах. Инфекция и иммунитет. 79 (7): 2856-64, 2011. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21576341

Sun X, Savidge T., Feng H. Энтеротоксичность токсинов Clostridium difficile. Токсины. 2 (7): 1848-80, 2010.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22069662

Sun X, He X, Tzipori S, Gerhard R, Feng H. Важная роль активности глюкозилтрансферазы в индуцированной токсином Clostridium difficile секреции макрофагами TNF-альфа.Микробный патогенез. 46 (6): 298-305, 2009.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19324080

He X, Wang J, Steele J, Sun X, Nie W, Tzipori S. , Фэн Х. Сверхчувствительный экспресс-анализ иммуноцитотоксичности для обнаружения токсинов Clostridium difficile. Журнал микробиологических методов. 78 (1): 97-100, 2009.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19393695

He X, Sun X, Wang J, Wang X, Zhang Q, Tzipori S. , Feng H. Усиленный антителами эндоцитоз, опосредованный Fc-гамма-рецептором, токсина A. Clostridium difficile.Инфекция и иммунитет. 77 (6): 2294-303, 2009.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19307220

Ян Г, Чжоу Б., Ван Дж, Хе Х, Сунь Х, Не В. , Tzipori S, Feng H. Экспрессия рекомбинантных токсинов A и B Clostridium difficile в Bacillus megaterium. BMC Microbiology. 8: 192, 2008.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/189

Sun X, Göhler A, Heller KJ, Neve H. Ген ltp фага Streptococcus thermophilus умеренного климата TP- J34 обеспечивает исключение суперинфекции для Streptococcus thermophilus и Lactococcus lactis.Вирусология. 350 (1): 146-57, 2006.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16643978

Sun X, Mierke DF, Biswas T, Lee SY, Landy A, Radman- Ливаджа М. Архитектура 99 п.н. ДНК-шестибелкового регуляторного комплекса лямбда-сайта att. Молекулярная клетка. 24 (4): 569-80, 2006.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17114059

Структурный и функциональный анализ нуклеотидной и ДНК-связывающей активности геликазы PIF1 человека. ORCA

Дехгани-Тафти, Саба, Левдиков, Владимир, Антсон, Альфред А., Бакс, Бен и Сандерс, Сирил М. 2019. Структурный и функциональный анализ нуклеотидной и ДНК-связывающей активности геликазы PIF1 человека. Исследование нуклеиновых кислот 47 (6) С. 3208-3222. 10.1093 / nar / gkz028

Аннотация

Pif1 — это многофункциональная геликаза и фермент процессинга ДНК, который играет роль в стабильности генома. Фермент сохраняется у эукариот, а также обнаруживается у некоторых прокариот.Функции человеческого PIF1 (hPIF1) также имеют решающее значение для выживания определенных линий опухолевых клеток во время репликационного стресса, что делает его важной мишенью для лечения рака. Кристаллические структуры hPIF1, представленные здесь, исследуют структурные события вдоль координаты химической реакции гидролиза АТФ с беспрецедентным уровнем детализации. Структуры апо, а также основное и переходное состояния обнаруживают конформационные корректировки в определенных сегментах белка, которые могут запускать более крупные перемещения доменов, необходимые для действия геликазы. Сравнение со структурами дрожжевого и бактериального Pif1 выявляет консервативный канал связывания оцДНК в hPIF1, который, как мы показываем, имеет решающее значение для связывания одноцепочечной ДНК во время раскручивания, но не для связывания квадруплексной ДНК G. Мутационный анализ предполагает, что хотя оцДНК-связывающий канал важен для активности геликазы, он не используется при отжиге ДНК. Структурные различия, в частности в области клина разделения цепей ДНК, подчеркивают значительное эволюционное расхождение белка PIF1 человека от бактериальных и дрожжевых ортологов.

Тип изделия: Статья
Тип даты: Публикация
Статус: Опубликовано
Школы: Биологические науки
Дополнительная информация: Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons CC BY, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии правильного цитирования оригинальной работы.
Издательство: Oxford University Press
ISSN: 0305-1048
Дата первого соответствующего депозита: 31 января 2019
Дата принятия: 11 января 2019
Последнее изменение: 09 ноя 2020 15:45
URI: http: // orca.cf.ac.uk/id/eprint/119057

Данные цитирования

Цитируется 5 раз в Scopus . Посмотреть в Scopus. На базе Scopus® Data

Действия (только сотрудники репозитория)

Изменить элемент

Широко распространенное семейство серин / треониновых протеинфосфатаз имеет общий регуляторный переключатель с протеасомными протеазами.

29.04.2021

Brosey, CA, Houl, JH, Katsonis, P., Balapiti-Modarage, LPF, Bommagani, S., Arvai, A., Moiani, D., Bacolla, A., Link, T., Warden, LS, Lichtarge , O., Jones, DE, Ahmed, Z., and Tainer, JA (2021) Ориентация на структуру макродомена Nsp3 SARS-CoV-2 с учетом структур поли (ADP-рибоза) гликогидролазы (PARG) человека с ингибиторами. Prog Biophys Mol Biol. 10.1016 / j.pbiomolbio.2021.02.002

08.04.2021

Чжан, К.- Х., Стоун, Э.А., Дешмук, М., Ипполито, Дж. А., Гахреманпур, М. М., Тирадо-Ривес, Дж., Спасов, К. А., Чжан, С., Такео, Ю., Кудалкар, С. Н., Лян, З. , Isaacs, F., Lindenbach, B., Miller, SJ, Anderson, KS, and Jorgensen, WL (2021) Мощные нековалентные ингибиторы основной протеазы SARS-CoV-2 в результате молекулярного моделирования лекарственного средства Perampanel на основе свободной энергии Расчеты возмущений. ACS Cent Sci. 7, 467-475

08.04.2021

Икетани, С., Forouhar, F., Liu, H., Hong, S. Jung, Lin, F. — Y., Nair, MS, Zask, A., Huang, Y., Xing, L., Stockwell, BR, Chavez, A., and Ho, DD (2021) Ведущие соединения для разработки ингибиторов протеазы SARS-CoV-2 3CL. Nat Commun. 12, 2016

07.04.2021

Черутти, Г., Го, Ю., Чжоу, Т., Горман, Дж., Ли, М., Рапп, М., Реддем, Э.Р., Ю, Дж., Бахна, Ф., Бимела, Дж., Хуанг, Ю., Кацамба, П.С., Лю, Л., Наир, М.С., Рави, Р., Оля, А.S., Wang, P., Zhang, B., Chuang, G. — Y., Ho, DD, Sheng, Z., Kwong, PD, and Shapiro, L. (2021) Мощные нейтрализующие антитела против SARS-CoV-2 направленный против шипа N-концевого домена, нацеленного на единственный суперсайт. Клеточный микроб-хозяин. 10.1016 / j.chom.2021.03.005

07.04.2021

Рапп, М., Гуо, Ю., Реддем, Э.Р., Ю, Дж., Лю, Л., Ван, П., Черутти, Г., Кацамба, П., Бимела, Д.С., Бахна, Ф.А., Маннепалли, С.М., Чжан, Б., Квонг, П.Д., Huang, Y., Ho, D. D., Shapiro, L., and Sheng, Z. (2021) Модульная основа для мощной нейтрализации SARS-CoV-2 с помощью преобладающего класса антител, производных от Vh2-2. Мобильный представитель 10.1016 / j.celrep.2021.108950

06.04.2021

Rostøl, JT, Xie, W., Kuryavyi, V., Maguin, P., Kao, K., Froom, R., Patel, DJ, and Marraffini, LA (2021) Нуклеаза Card1 обеспечивает защиту во время CRISPR III типа. иммунитет .. Природа. 590, 624-629

22.03.2021

Тайеб-Флигельман, Э., Cheng, X., Tai, C., Bowler, JT, Griner, S., Sawaya, MR, Seidler, PM, Jiang, Y. Xiao, Lu, J., Rosenberg, GM, Salwinski, L., Abskharon, Р., Зи, К. — Т., Хоу, К., Ли, Ю., Бойер, Д. Р., Мюррей, К. А., Фалькон, Г., Андерсон, Д. Х., Кашио, Д., Сэлис, Л., Дамуазо, Р., Го, Ф., и Айзенберг, Д.С. (2021) Ингибирование образования амилоида нуклеопротеина SARS-CoV-2. bioRxiv. 10.1101 / 2021.03.05.434000

02.03.2021

Ю., Ц.Х., Бхаттачарья, А., Персо, М., Тейлор, А.Б., Ван, З., Булнес-Рамос, А., Сюй, Дж., Селютина, А., Мартинес-Лопес, А., Кано, К. , Демелер, Б., Ким, Б., Харди, С.К., Диаз-Грифферо, Ф. и Иванов, Д.Н. (2021) Связывание нуклеиновой кислоты с помощью SAMHD1 способствует антиретровирусной активности и усиливается модификацией GpsN. Nat Commun. 12, 731

01.03.2021

Воробьева, А.А., Уайт, П., Лян, Б., Хорн, Дж. Э., Бера, А. К., Чоу, К.М., Гербен, С., Маркс, С., Кан, А., Стивинг, А. К., Харви, С. Р., Маркс, Д. К., Дж. Хан, Н., Флеминг, К. Г., Высоцкий, В. Х., Броквелл, Д. Д., Тамм, Л.К., Рэдфорд, С.Е., и Бейкер, Д. (2021) Дизайн de novo трансмембранных β-цилиндров. Наука. 10.1126 / science.abc8182

28.12.2020

Кларк, С.А., Кларк, Л.Е., Пан, Дж., Кошиа, А., Маккей, LGA, Шанкар, С., Джонсон, Р.И., Гриффитс, А., и Абрахам, Дж. (2021) SARS-CoV-2 эволюция в организме хозяина с ослабленным иммунитетом обнаруживает общие механизмы нейтрализации.Клетка. 10.1101 / 2020.11.13.381533

01.12.2020

Линь, Л. Инки, Маккарти, С., Пауэлл, Б.М., Манурунг, Ю., Сян, И.М., Дин, В.Л., Чаирес, Б., и Яцуник, Л.А. (2020) Биофизические и рентгеноструктурные исследования (GGGTT) 3GGG G-квадруплекс в комплексе с N-метилмезопорфирином IX. PLoS One. 15, e0241513

11.11.2020

Лю С., Ли С., Шен Г., Сукумар Н., Крезель А. М. и Ли В. (2020) Структурные основы противодействия каталитическому циклу витамина К для антикоагуляции. Наука. 10.1126 / science.abc5667

23.10.2020

Рут, В., Львов, З., Змудзински, М., Патчетт, С., Наяк, Д., Снипас, С.Дж., Уалид, Ф. Эль, Хуанг, Т.Т., Бекеш, М., Драг, М., и Olsen, SK (2020) Профилирование активности и кристаллические структуры связанной с ингибитором папаин-подобной протеазы SARS-CoV-2: основа для разработки лекарств против COVID-19.Sci Adv. 10.1126 / sciadv.

Ответить

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *